前往音韵市途中，主角偶遇久未相见的小瑶。小瑶一直在寻找主角，表现出明显担忧。随后双方展开对战，主角凭借精灵实力获胜，小瑶确认其安好后赠予“飞翔技能器”。

继续前行时，主角遇到雅西达，从其手中获取“骑行装置”。

抵达飞行系道馆门前，主角意外和真司相遇。真司立即发起挑战。首回合，真司派出王牌精灵超级波士可多拉；主角则派出大狼犬应战。面对超级波士可多拉的“重磅冲撞”，大狼犬依靠气息腰带硬接下攻击，随即以“气息吹袭”反制。超级波士可多拉随即运用“冰冻拳”击倒大狼犬，自身因招式反影响陷入沉睡情形。

主角立刻替换上场大凶肠。利用超级波士可多拉沉睡时机，大凶肠连续运用“龙之舞”提高能力，迅速完成三次强化，同时凝聚气场引发降雨。随后发动“水流尾”，精准命中，将超级波士可多拉击倒。

战胜真司后，主角获取挑战飞行系道馆馆主娜琪的资格。娜琪首只出场精灵为烈雀，运用“剑舞”提高攻击力。主角派出墨菲特，在场地布下“隐形岩”。第二回合，墨菲特运用“延时暴击”攻击烈雀；烈雀则以“急速折返”造成伤害并换下，由康辉鸭登场。

康辉鸭运用“红牌”将墨菲特罚出场外。主角随即换上烈箭雀。烈箭雀和钢盔甲对峙，率先运用“蓄能焰袭”进攻；钢盔甲选择承受伤害并同步运用“剑舞”强化自身。第二回合，烈箭雀再次发动“蓄能焰袭”，重创钢盔甲；钢盔甲则以“勇猛冲锋”反击，一击将烈箭雀击倒，自身亦因反噬陷入濒死情形，达成一换一。

主角随即派出大狼犬，对七夕青鸟运用“哈欠”，使其陷入睡眠。七夕青鸟在睡眠中进化为超级七夕青鸟，并发动“地震”重创大狼犬。主角立即换上大颚蚁，在超级七夕青鸟持续沉睡期间，连续运用三次“龙之舞”叠满三层强化，最终成功击败对手，清空娜琪全部阵型，赢得飞行系徽章。

通关飞行系道馆后，主角和娜琪共同享用晚餐。

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