长津市道馆馆主为火箭队首领坂木，其主力精灵包括代兽、超级沙漠蜻蜓以及一只特性和究极绿版不同的铠甲超梦。该版本铠甲超梦拥有更高的基础速度和爆用劲，对战难度显著提高。

排烟怪和波士可多拉亦为坂木阵型组成部分。联盟挑战开始前，玩家将解开一只黑色洛奇亚，但该个体不携带“黑暗气场”和“多重鳞片”等实用特性。

武道雄狮可在集聚巢穴中捕捉，但仅能进修格斗系技能，无法习得其他属性招式，因此实战价格受限，通常被言败培养。

本版本冠军之路流程大幅简化：联盟入口处不再配置复杂解谜或推石机关，玩家抵达后直接触发决定因素剧情。

在联盟大门前，大木博士主动发起对战。其队伍由水晶龟、肯泰罗、妙蛙花、喷火龙、卡比兽和快龙组成。击败大木博士后，获取水滴石板及水箭龟，但此时仍无法正式挑战联盟，需先完成七岛主线。

七岛任务起始于伊兹岛，和阿瑾对话触发初始剧情。随后返回伊兹岛深处寻找红宝石，但须先前往沙滩洞窟和洞中老人对话，习得缩颜术，方可顺利进入岛屿深层区域获取红宝石。

将红宝石交付阿瑾后，剧情推进，其余四座岛屿同步解开。此时不可直接寻找蓝宝石，须先前往狮子岛右上角冰窟——先进入左侧山洞取得攀瀑技能机，再利用该技能抵达冰窟深处，营救失踪的克娜并瓦解当地火箭队据点，从而开始蓝宝石相关剧情。

蓝宝石位于六字岛右下角的点之穴。在铁门前运用聚合斩技能开始入口，内部途径为“上→左→右→下”，即可抵达蓝宝石所在位置。

随后前往五只岛右下方火箭队仓库，击败驻守成员和研究员，夺回蓝宝石并交予阿锦，七岛全部任务即告完成。

回归联盟后，挑战四大天王。首位天王科拿的阵型包括九尾、双倍多多、冰鬼护、雪妖女、成龙、雷吉艾斯。虽然存在两种难度玩法，但整体挑战压力可控，困难玩法下的科拿亦无显著压制性。

第二位天王希巴以格斗系精灵为主，阵型为路卡利欧、战舞郎、铁掌力士、头巾混混、穿山王、戴鲁比、达克莱伊、武道熊师（一击流形态）。

第三位天王阵型包含迷拟Q、破破舵、幽灵马形态雷冠王、耿鬼、坚盾剑怪、多龙奇。

第四位天王阵型为沙漠蜻蜓、雷电云（异色）、铝钢龙、毒刺水母、三首恶龙、拉帝欧斯。

最终冠军为青绿，其首发精灵为携带气球的杰拉奥拉。该个体免疫一般系招式，需针对性选用克制属性攻击手段。后续出场精灵依次为战舞郎、化石翼龙、赤甲贝、波克基斯、火神蛾。

通关伊之柱主线后，游戏进入自在寻觅阶段，主要目标包括神兽捕捉和隐藏对战彩蛋触发。

华兰洞窟中的超梦为重要捕捉目标，但需先击败被称为“传奇训练师”的NPC。其队伍包含苍响、超级裂空座、光辉大神、雷冠王（幽灵马形态）、原始固拉多、凤王，整体强度处于T0级别，需谨慎配置战略和道具应对。

击败传奇训练师后，方可进入巢穴捕捉超梦。后期各巢穴每隔固定时刻随机刷新野生精灵，其中神兽出现概率较高。

完成超梦捕捉后，玩家可体系寻觅关都地区全地图，涵盖七之岛全域。期间可发现异兽、神兽分布点，并触发和各地区冠军的限量对战彩蛋，同时收集各类独特超进化石。

然而，海皇牙、时空双神（帝牙卢卡、帕路奇亚）、凤王、洛奇亚及神柱王等神兽，在当前版本中暂未放开明确的捕捉地点和方式，相关线索和机制尚未实装。

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